Untuk jenjang sekolah menengah, Arifatul diketahui bersekolah di Madrasah Tsanawiyah dan Madrasah Aliyah As Syafiiyah Jatiwaringin.
Setelah menyelesaikan pendidikan menengah, ia melanjutkan studi di Fakultas Dakwah Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Yogyakarta.
Kampus tersebut kini dikenal sebagai Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Kalijaga Yogyakarta. Ia menyelesaikan pendidikan sarjana pada tahun 1994.
Tak berhenti di sana, Arifatul melanjutkan pendidikan pascasarjana dan meraih gelar Magister Ilmu Komunikasi dari Universitas Indonesia pada tahun 2002. Gelar tersebut diraih melalui dukungan beasiswa Ford Foundation.
Suami Arifatul Choiri Fauzi sendiri bernama Sastro Al Ngatawi. Ia merupakan tokoh yang dikenal di lingkungan Nahdlatul Ulama (NU). Sastro lahir di Pati pada 27 Agustus 1966.
Dalam perjalanan organisasinya, ia pernah menjabat sebagai Ketua Lembaga Seni Budaya Muslim Indonesia (Lesbumi) Pengurus Besar Nahdlatul Ulama (PBNU).
Selain aktif di dunia kebudayaan, Sastro juga dikenal sebagai aktivis sosial. Ia pernah terlibat dalam advokasi masyarakat di kawasan Waduk Kedung Ombo.
Keterlibatan Sastro di bidang seni dan sosial turut melengkapi profil keluarga Arifatul yang lekat dengan aktivitas kemasyarakatan.
Lebih lanjut, perjalanan Arifatul di dunia organisasi dimulai sejak usia muda. Ia pernah menjabat sebagai Ketua Umum Ikatan Pelajar Putri NU (IPPNU) Daerah Istimewa Yogyakarta pada periode 1989 hingga 1991.
Setelah itu, Arifatul menempati berbagai posisi strategis di lingkungan organisasi NU, di antaranya sebagai Sekretaris Jenderal Pimpinan Pusat Fatayat NU serta Sekretaris Pimpinan Pusat Muslimat NU.
Ia juga aktif di Majelis Alimat Indonesia dan Majelis Ulama Indonesia (MUI), khususnya pada bidang informasi dan komunikasi.
