Periode pertama, yaitu pada 2007-2011. Lalu, dirinya kembali terpilih untuk memimpin PPP selama periode 2011-2014.
Kemudian, Suryadharma Ali semakin dikenal publik setelah ia dipercaya menjadi Menteri Agama RI pada 2009-2014.
Sayangnya, karier politik Suryadharma nAli tak lepas dari kontroversi. Ia ditetapkan sebagai tersangka dalam kasus korupsi dana haji pada 23 Mei 2014.
Setelah itu, Suryadharma mengajukan pengunduran diri sebagai Menteri Agama dan resmi mundur pada 28 Mei 2014.