Setelah Kunaefi meninggal dunia, Saepul kemudian memutilasi jasad korban. Kepada penyidik, tersangka mengaku tindakan tersebut dilakukan agar jasad lebih mudah dibawa keluar dari kontrakan sekaligus untuk menghilangkan jejak.
Meski pemicu pertengkaran dan rangkaian kejadian sebelum pembunuhan telah terungkap, polisi masih mendalami motif secara keseluruhan dalam kasus tersebut.
Penyelidikan awal menunjukkan Saepul dan Kunaefi merupakan dua orang yang saling mengenal. Polisi masih menggali lebih jauh hubungan keduanya serta faktor lain yang melatarbelakangi pembunuhan hingga mutilasi tersebut.
